Durante 2025 se reportó que el Tren Maya, en conjunto con los hoteles administrados por la Secretaría de la Defensa Nacional, registró pérdidas superiores a los 6 millones de pesos
Se informó un recorte de 559 millones de pesos para 2026 en las aportaciones destinadas al estado de Puebla, que serían utilizadas en servicios de salud